Массовый поиск аттенюаторной регуляции в геномах протеобактерий

СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
ГЛАВА 1. ДВА АЛГОРИТМА И КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА ПОИСКА ПОТЕНЦИАЛЬНЫХ АТТЕНЮАТОРНЫХ РЕГУЛЯТОРНЫХ СТРУКТУР
1.1. Первый алгоритм
1.2. Второй алгоритм
1.3. Сравнение результатов работы первого и второго алгоритмов
ГЛАВА 2. ТЕСТИРОВАНИЕ АЛГОРИТМОВ.
2.1. Второй алгоритм тестирование на случайных последовательностях
2.2. Второй алгоритм тестирование на случайных последовательностях с участком остатков урадила и
2.3. Второй алгоритм тестирование на случайных последовательностях, содержащих биологически значимые терминаторы
2.4. Первый и второй алгоритмы тестирование на биологических последовательностях, содержащих аттенюаторную структуру
2.5. Второй алгоритм тестирование на биологических последовательностях, содержащих альтернативные структуры типа Тбокс
2.6. Второй алгоритм тестирование на биологических последовательностях, не содержащих аттенюаторов по результатам работы первого алгоритма
ГЛАВА 3. МАССОВЫЙ ПОИСК АТТЕНЮАТОРНОЙ РЕГУЛЯЦИИ
3.1. Особенности аттенюаторной регуляции биосинтеза гистидина, треонина, разветвленных и ароматических аминокислот
3.2. Метаболические пути, оперонные структуры и выравнивания аттенюаторов изученных оперонов
3.3. Характерные аттснюаторные структуры, найденные алгоритмом
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.
ЛИТЕРАТУРА